Hunde opdrættes til bestemte fysiske karakteristiske idealer eller standarder.
I en grad tjener indavlning til at forbedre og perfektere en hundesort ved at sammenkoble prøver med fremragende træk. Det kan dog også begrænse den tilgængelige genpool, hvilket forårsager problemer, da også nært beslægtede dyr anvendes over generationer til avl i en enkelt linje, såsom fædre opdrættet med døtre eller søskende opdrættet sammen. Sådan indavl kan fremme generationer af hunde, der bliver sygdomme, som er infertile eller som udvikler potentielt dødelige svagheder i deres immunsystem.
Fertilitetsproblemer
Den forsigtige opdrætter kan genkende hvornår indavl har gået ud over sine grænser, når hundehundene gentagne gange begynder at levere usunde, desinficerede eller små kuld, eller når barnedødeligheden øges væsentligt. Også dybt indavlede hundehunde har en tendens til at have nedsat frugtbarhed, hvilket gør en vellykket opdræt meget vanskelig. Et usædvanligt kuld kan i sig selv ikke tilskrives indavl, men hvis de fortsætter gang for gang, er genetisk disponering normalt årsagen til problemet.
Avl for særlige træk
Selektiv opdræt betyder, at opdrætteren har en hund med unikke træk og ønsker at genskabe disse træk ved hjælp af familiedyr. Dette kræver kun avlsdyr, der bærer det unikke træk i deres gener. Dette begrænser nødvendigvis den mulige genpool, som i sidste ende kan føre til indavlede knogleredskaber og degenerative lidelser som arthritis. Andre alvorlige problemer er, at hovedet er for stort til naturlige fødsler og nedsat immunitet, hvilket gør prøverne mere modtagelige for sygdom.
Patellar Luxation og Hip Dysplasi
Patellar luxation er en genetisk tilstand, der involverer forskydning af knæhætten, der primært påvirker små hunde som Boston og Yorkshire terrier, Chihuahuas, Pomeranians og miniaturepoodler. Det påvirker begge knæ i halvdelen af sagerne, hvilket resulterer i lammende smerter. Dysplasi er tilstanden af hofteforbindelsen løs, hvilket får hoften til nemt at trække sig ud af leddet. Dette fører normalt til slidgigt eller degenerativ ledsygdom. Disse forhold forårsager en hunds smerte og invaliditet.
Adfærdsproblemer og intelligens
Selvom det ikke altid er, kan aggression ofte være et alvorligt problem med indavlede hunde. Dette resulterer i at bide uden grund, angribe folk, jagter biler eller mennesker eller andre dyr og spiller for groft. Inavlede hunde har også ofte meget lavere intelligens end mindre indavlede medlemmer af samme race. Disse hunde kan være vanskelige at træne på grund af deres nedsatte intelligens, som - som supplement til deres naturlige tendens til aggressivitet - kan gøre dem uønskede som kæledyr.
